与大气和水污染相比，土壤修复显得更加困难。农业部农产品产地土壤重金属污染防治专家组成员、中国农业大学资源与环境学院教授苏德纯表示，不仅土壤污染危害严重，并且与一些有机污染物不同，土壤中的重金属无法降解，与土壤分离难度非常大，修复非常困难。中国科学院地理科学与资源研究所环境修复研究中心主任陈同斌也曾表示，即使是轻度污染的地方，要除掉土壤中的重金属最快也要三到五年。

不仅如此，土壤修复成本还很昂贵。据业内人士透露，即使采取较便宜的办法如植物修复法修复土壤，每亩的修复成本也达到两万元，还需连续种植数年，总投入数额惊人。如果按照每亩地修复成本两万元、以罗锡文所称全国3亿亩耕地重金属污染计算，总体算下来，我国耕地修复总体所需资金将达6万亿元。据悉，上世纪70年代日本富山县土壤修复一共863公顷(12945亩)农田，总共投入3.4亿美元，花费了33年时间进行客土法修复完成，平均每亩修复费用近18万元人民币。由此看来，用于全国包括受污染农田、城市“棕色地块”及工矿区污染场地等的修复市场将需要巨额资本投入，土壤修复产业的发展任重而道远。

当前，污染底数不清、法规标准缺失、环境监管滞后、科技支撑有限、协调机制不畅、行业呈现失序增长等问题正制约着土壤污染修复产业发展，我国亟须规范市场秩序，促进包括土壤检测、治理修复、设施设备、药剂等土壤修复相关产业的发展。目前，永清环保、中节能、铁汉生态、聚光科技、华测检测等已经进入土壤修复市场，桑德环境、东江环保和维尔利等也开始了在这一领域的战略布局。