针对地下污水处理厂建设争议最大的问题就是其投资成本高的问题。有专家表示，“表面看来，地下污水处理厂的投资成本较高，但是随着城市可利用土地资源日趋减少，土地价格逐渐增高时，地下污水处理厂的价值就会显现出来。如果考虑上土地价值、环境价值，地下污水处理厂的‘性价比’与地上式相差无几。”据了解，烟台古县污水处理厂工程预计投资1.6亿元，建设成本相当于普通污水处理厂的一倍。但项目负责人称“虽然投资额大，但节省出来的地上空间价值，远远超过多出来的建造成本。”

国外在地下污水处理厂建设方面发展较早，如美国、英国、日本、韩国、瑞典等发达国家地下污水处理厂均取得了巨大的经济、社会效益。据了解，韩国约有大于50%的污水处理厂建在地下，瑞典所有污水处理厂均建在地下。

近年来，我国开建了多个地下污水处理厂，在北京、深圳、青岛、烟台、昆明、合肥、苏州、厦门、桂林、台北等地陆续有地下污水处理项目上马。

有专家表示，目前，地下污水处理厂在技术上已经相当成熟，在国内外也有很多成功的应用案例，对于经济发达、土地资源高度紧张、环境要求高的地区，地下污水处理厂建设将成为一种趋势，并且，从长远来看，也符合资源节约、人与自然和谐发展的科学发展观的要求。