近几年，我国对制药废水的治理日益加强，2008年第一版制药工业水污染物排放标准正式出台。虽然这套标准COD、氨氮等指标高过美国的排放标准，但相对美国标准对特殊污染物还缺乏比较严格的控制。 

制药废水的治理应该逐渐从企业自身行为发展为国家战略层面的重要工作，在“十二五”期间制定治理规划与建议。在治理的思路上，宋永会表示，应该首先从制药工艺上入手，提高产品收率、有机溶剂回收率，废水的处理过程要选择先进、成熟的水污染防治技术，并要考虑生物安全性等因素，有害污染物应在进入企业的车间排放口前就进行处理。 

废水中有毒有害物质的处理、废水处理后尾水的处理、废水中氨氮的处理，宋永会认为这是制药废水治理领域需要加强技术研发的三个方面。为了应对制药废水的特点，处理的技术需求在于，解除微生物毒性、提高废水可生化性的物化预处理，用生物强化处理实现废水终处理和达标排放。 

最新的黄连素废水、金刚烷胺废水和磷霉素钠废水三种难处理废水处理的新技术。其中，特别强调了水解酸化-接触氧化生物共代谢集成技术和铁碳微电解回收铜集成技术，前者对废水中的总磷去除效果明显，平均去除率达到了42%，尤其对还原有机磷具有独特的优势，后者对废水中的铜离子去除效果显著，平均去除效率可达到了90%以上。 

对于制药废水治理技术发展，珂沅环保认为，水环境的治理与保护要求制药废水处理的标准越来越高，亟需展开预处理和集成工艺的技术研发和应用，研究证明了许多新技术的可行性，物化法等技术可提高难降解制药废水可生化性和实现资源化。 

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